企業の業界とサイズによって、理想的な形は違うと思います。
広告会社のような創造力が必要な会社は、ボトムアップのほうがいいと思います。社員に新しいアイデアをどんどん作らせるため、自由に発言できる雰囲気は不可欠です。トップダウンの場合は配慮しなければならないことはボトムアップの場合より多いですから、皆いいアイデアと考えがあっても黙るかもしれません。
大きな会社の場合は、社員の人数が多いですから、ルールがなければ大変です。それに、命令と情報の伝達は時間がかかります。その場合はトップダウンのほうがふさわしいと思います。
今働いている職場はとても大きいですから、指示がトップダウンの場合が多いです。私みたいな怠け者の社員にとって、トップダウンのほうが楽です。ただ上司の指示の通りに仕事をやって、頭を使わなくても仕事が進められます。それに、ミスのチャンスは低いです。